肠道有害菌喜欢吃高脂肪、高糖、高蛋白质的食物，如油炸食品、糖果、巧克力、蛋糕、肉类等。它们还喜欢吃不新鲜、不干净的食物，如变质的食品、不洁的水果蔬菜等。肠道有害菌也会生长繁殖在不健康的肠道环境中，如缺乏膳食纤维、水分不足等。保持饮食健康，多摄入膳食纤维、饮用充足的水、少吃高脂肪、高糖、高蛋白质的食品，可以有效地抑制肠道有害菌的生长。
肠道微生态失衡是肠道菌群在种类、数量、比例或分布上发生异常改变的状态，其本质是肠道菌群与宿主、环境间的动态平衡被打破。例如，长期服用广谱抗生素可能使肠道菌群多样性下降，引发抗生素相关性腹泻。
