肠道菌群在遭受一些不良环境的影响之后，可能会受到一定程度的破坏或失衡。肠道菌群具有一定的恢复能力，可以通过调整饮食习惯、增加饱和脂肪酸和纤维素的摄入、增加有益菌的摄入等方法来促进肠道菌群的恢复和重建。避免过度使用抗生素和其他药物、降低压力、增加运动和睡眠等措施也有助于维护肠道菌群的健康和平衡。
肠道微生态失衡是肠道菌群在种类、数量、比例或分布上发生异常改变的状态，其本质是肠道菌群与宿主、环境间的动态平衡被打破。例如，长期服用广谱抗生素可能使肠道菌群多样性下降，引发抗生素相关性腹泻。
