皮蛋存放在低温、干燥、通风的地方，避免阳光直射和潮湿。可将皮蛋放入密封的塑料袋或容器中，放入冰箱冷藏室内保存，保存时间不宜过久，一般不超过一个月。皮蛋也可以用大米或者盐封存，方法是将皮蛋用干净的布包裹起来，再放入干燥无水的大米或盐中，密封保存。
如果是皮蛋瘦肉粥，只是吃一点点的皮蛋可以的，如果是急性胃炎期间也不建议吃皮蛋。因为皮蛋是蛋类的再加工食品，也跟腌制类的食物一样，会有对健康不利的因素，不建议多吃。
