1. 乳酸菌类：包括常见的嗜酸乳杆菌、双歧杆菌、乳双歧杆菌等。这些菌属于肠道内常驻菌群，能够抑制有害菌生长，增强肠道免疫力。
2. 可产生短链脂肪酸的细菌：这些细菌主要包括菌群、棒状菌等。它们通过分解膳食纤维，产生短链脂肪酸，促进肠道蠕动，维持肠内微生态平衡。
3. 异养菌类：包括酵母菌、乳酸菌以外的菌类。这些菌可以在肠道内通过吸收营养物质而生长和繁殖，具有调节肠道菌群、增强免疫力等作用。
