肠道功能紊乱（例如肠易激综合征）是指消化系统出现了不正常的节律，如腹泻、便秘、腹痛、腹胀等，但这些症状并没有特定的病理学依据，可以完全正常。而肠炎则是指肠道发生了炎症反应，常见症状包括腹泻、腹痛、恶心、呕吐、发热等，是由于感染、食物中毒、过敏等原因引起的。肠道功能紊乱和肠炎在病因和症状上有所区别。
肠道微生态失衡是肠道菌群在种类、数量、比例或分布上发生异常改变的状态，其本质是肠道菌群与宿主、环境间的动态平衡被打破。例如，长期服用广谱抗生素可能使肠道菌群多样性下降，引发抗生素相关性腹泻。
