氨的主要来源有肠道吸收和肝脏代谢。
肠道吸收是指通过食物摄入的蛋白质经过胃酸分解和胃蛋白酶的作用，形成小肽和游离氨基酸，在小肠黏膜上被氨基酸转运体吸收进入血液循环。
肝脏代谢是指肝脏对摄入的氨进行代谢。肝脏能够将游离氨基酸转化为尿素，通过尿液排出体外。这个过程被称为尿素循环。在尿素循环中，氨基酸被氨基转移酶转移氨基团，生成谷氨酰胺，再由谷氨酰胺酶与二氧化碳结合，形成尿素。
小部分氨还可以由细菌在肠道内产生，但这只是氨的次要来源。
肠道微生态失衡是肠道菌群在种类、数量、比例或分布上发生异常改变的状态，其本质是肠道菌群与宿主、环境间的动态平衡被打破。例如，长期服用广谱抗生素可能使肠道菌群多样性下降，引发抗生素相关性腹泻。
