人体内的大量微生物群体，主要包括细菌、真菌、病毒和寄生虫等。其中，细菌是最主要的成员，约占总量的99%。常见的肠道细菌包括双歧杆菌、链球菌、梭状芽孢杆菌、乳酸杆菌、肠球菌等。不同的个体、不同的生活环境和饮食习惯，肠道菌群的种类和数量也会有所不同。
肠道微生态失衡是肠道菌群在种类、数量、比例或分布上发生异常改变的状态，其本质是肠道菌群与宿主、环境间的动态平衡被打破。例如，长期服用广谱抗生素可能使肠道菌群多样性下降，引发抗生素相关性腹泻。
