肠道免疫系统是指分布在肠道黏膜及其下方的一系列免疫器官和细胞，包括肠道上皮细胞、肠道M细胞、肠淋巴组织、肠间质细胞、肠道内皮细胞和肠道神经元等，它们协同工作，保护肠道免受有害微生物和毒素的攻击，并促进肠道内益生菌的生长，维持肠道健康。肠道免疫系统不仅是肠道自身的防御机制，也参与调节全身免疫反应和代谢过程。
肠道微生态失衡是肠道菌群在种类、数量、比例或分布上发生异常改变的状态，其本质是肠道菌群与宿主、环境间的动态平衡被打破。例如，长期服用广谱抗生素可能使肠道菌群多样性下降，引发抗生素相关性腹泻。
