肠道内感染可以由多种微生物引起,包括细菌、病毒、寄生虫和真菌。常见的肠道细菌感染包括沙门氏菌、大肠杆菌、霍乱弧菌等;病毒感染包括诺如病毒、轮状病毒等;寄生虫感染包括蠕动虫、阿米巴虫等。这些微生物可以通过食物或水源的污染,接触感染者的粪便、口腔分泌物等途径传播进入肠道引起感染。