肠道细菌可以分为三大类菌，包括有益菌、中性菌和有害菌。有益菌包括乳酸菌、双歧杆菌等，可以促进肠道健康、帮助消化吸收、增强免疫力；中性菌一般不对人体有害也不有益；有害菌包括肠球菌、大肠杆菌等，可能导致肠道感染、腹泻等问题。
肠道微生态失衡是肠道菌群在种类、数量、比例或分布上发生异常改变的状态，其本质是肠道菌群与宿主、环境间的动态平衡被打破。例如，长期服用广谱抗生素可能使肠道菌群多样性下降，引发抗生素相关性腹泻。
