人类肠道菌群含有数千种微生物群落，其中包括细菌、真菌、病毒等。每个人的肠道菌群都不同，其占比也存在差异。一般而言，肠道中细菌的数量比其他微生物多，约占菌群总量的90%以上，而整个菌群的总量大约为100万亿个细胞。具体的菌群占比因人而异，取决于不同的饮食、环境和遗传因素等。
肠道微生态失衡是肠道菌群在种类、数量、比例或分布上发生异常改变的状态，其本质是肠道菌群与宿主、环境间的动态平衡被打破。例如，长期服用广谱抗生素可能使肠道菌群多样性下降，引发抗生素相关性腹泻。
