清肠可能会破坏肠道菌群，这取决于清肠的具体方法和频率。使用药物、灌肠或排毒饮食可能会影响肠道菌群的平衡，导致有益菌的减少和有害菌的增加。如果要进行清肠，应该选择较温和的方法，如增加膳食纤维摄入量、多吃发酵食品、减少对不健康食物和药物的依赖。在专业医生或营养师的指导下进行清肠。
肠道微生态失衡是肠道菌群在种类、数量、比例或分布上发生异常改变的状态，其本质是肠道菌群与宿主、环境间的动态平衡被打破。例如，长期服用广谱抗生素可能使肠道菌群多样性下降，引发抗生素相关性腹泻。
