菌群的交换指的是不同环境中的微生物共同体或者微生物菌群相互交换微生物群落的过程。这种交换可以是自然发生的，比如不同生态系统之间的微生物群落交换，也可以是人为引导的，比如人类在种植作物时利用农业生物技术引导土壤微生物群落的交换。通过菌群的交换，可以促进微生物之间的合作和相互依赖关系，从而对生态系统的稳定性和功能发挥起到重要的作用。
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