微生物肠道菌是指在人体肠道内生活的微生物，包括细菌、真菌、寄生虫等。这些微生物在人体内有着重要的生态作用，帮助消化、吸收营养物质，保护宿主机体免受外界微生物的侵袭，并对人体免疫系统的发育、功能和整体健康起到重要作用。研究表明，肠道微生物群落的紊乱与多种疾病的发生和发展有关，例如肥胖症、炎症性肠病、自身免疫性疾病等，因此调节微生物菌群平衡对人体健康有着重要的意义。
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