交换肠道菌群指的是通过移植一部分肠道菌群，将健康个体的肠道菌群转移到另一位患有肠道菌群失衡的个体身上，以达到恢复肠道菌群平衡的目的。这种方法目前主要应用于治疗患有难治性肠炎、胃肠病等疾病的患者。交换肠道菌群可以在一定程度上提高人体免疫力，改善肠道消化和吸收功能，并对一些自身免疫性疾病（如炎症性肠病、哮喘等）有治疗作用。尽管目前交换肠道菌群的疗效已经得到了广泛证实，但其长远风险和安全性仍有待探究和评估。
肠道微生态失衡是肠道菌群在种类、数量、比例或分布上发生异常改变的状态，其本质是肠道菌群与宿主、环境间的动态平衡被打破。例如，长期服用广谱抗生素可能使肠道菌群多样性下降，引发抗生素相关性腹泻。
