在人类身体内，肠道细菌数量最多的是属于厌氧菌门的菌群，包括肠球菌、双歧杆菌、梭菌等。这些细菌主要存在于大肠中，其数量可达到数十万亿个，远远超过人类细胞数量的10倍以上。这些肠道细菌对人类的健康有着重要的影响，能够帮助消化食物、合成维生素、调节免疫系统等。
肠道微生态失衡是肠道菌群在种类、数量、比例或分布上发生异常改变的状态，其本质是肠道菌群与宿主、环境间的动态平衡被打破。例如，长期服用广谱抗生素可能使肠道菌群多样性下降，引发抗生素相关性腹泻。
