1. 大肠杆菌（Escherichia coli）
2. 沙门氏菌（Salmonella）
3. 肠球菌（Staphylococcus aureus）
4. 腸炎弧菌（Vibrio cholerae）
5. 芽孢杆菌（Clostridium）
6. 嗜酸乳杆菌（Lactobacillus）
7. 弗氏菌（Shigella）
8. 病毒性感染，如诺如病毒（Norovirus）、轮状病毒（Rotavirus）等。
肠道微生态失衡是肠道菌群在种类、数量、比例或分布上发生异常改变的状态，其本质是肠道菌群与宿主、环境间的动态平衡被打破。例如，长期服用广谱抗生素可能使肠道菌群多样性下降，引发抗生素相关性腹泻。
