肠道损伤自我修复时间因损伤程度而异。浅表性损伤一般在数天内可自我修复，严重损伤需要数周至数月甚至更长时间。修复时间还受到营养状态、免疫功能等多种因素的影响。在肠道修复期间，适当的营养支持和保护性措施可以帮助肠道修复，促进愈合。
肠道微生态失衡是肠道菌群在种类、数量、比例或分布上发生异常改变的状态，其本质是肠道菌群与宿主、环境间的动态平衡被打破。例如，长期服用广谱抗生素可能使肠道菌群多样性下降，引发抗生素相关性腹泻。
