大蒜中含有一种化合物叫做大蒜素，这种化合物具有强烈的辛辣味道和刺激性。吃生大蒜时，这种化合物会直接作用于口腔黏膜，刺激神经末梢，导致口腔发热、发痛、流泪等不适感觉。生蒜中的辛辣成分也会刺激肠胃黏膜，引起胃肠道不适甚至腹泻。生吃大蒜时需要适量，不宜过量。
大蒜是食物，并不是药物或者抗生素类的产品，不能吃大蒜来当消炎药使用。吃大蒜也不会破坏肠道内的菌群水平，生吃大蒜是可以帮助预防肠道内感染和流感等，大蒜里面对健康有益的是大蒜素成分，是对抑制和清除致病真菌，滴虫钩虫等有帮助的。
