衣原体是一类细胞内寄生的微生物,它们的遗传物质和细胞结构与细菌有很大的不同。在形态结构上,衣原体的大小比大部分细菌小,它们没有细胞壁,且没有一些细胞器如线粒体和叶绿体。衣原体的DNA排列方式也不同于细菌,它们的DNA分散在原生质内而不是呈现出典型的细菌核。衣原体的代谢方式与细菌也有显著区别,衣原体不能自主合成ATP,需要从宿主细胞中获取能量。