厚壁菌门包括一些极端环境下生存的细菌，如产生芳香酮的产气杆菌和产硫薄糠菌等。这些菌对于生态系统、环境修复和工业生产等方面具有一定重要性，但并不一定被视为有益菌。由于这些菌的生存环境极其特殊，因此在人类健康方面的应用还相对较少。
