菌群移位既可以是纵向的，也可以是横向的。纵向的移位指的是在同一生态系统内，某些菌群的数量增加或减少，而其他菌群数量不变。例如，一些环境条件的改变可能导致某些细菌的数量增多，而其他细菌的数量减少。这种变化通常是由生态因素引起的，而且变化速度较慢。
横向的移位则指的是不同生态系统之间的菌群变化。例如，由于人类活动的影响，一些细菌可能从一个生态系统移动到另一个生态系统。这种变化可能是突然的，也可能是逐渐的。横向移位可能会导致新的菌群在新生态系统中形成，或影响现有菌群的数量和种类。
